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分子实验笔记23:重组抗体的考马斯亮蓝纯度染色分析(Coomassie Purity Stain of Recombinant Antibodies)

来源:武汉市灰藻生物科技有限公司   浏览量:4   发布时间:2026-05-29 16:25:48

一、引言

本方案描述了如何使用即用型生物安全考马斯亮蓝 G-250 染色剂和 ImageJ 软件来测定重组抗体的纯度和浓度。样品通过变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)与已知浓度标准抗体的连续稀释液一同分离。在用考马斯亮蓝染色后,使用 ImageJ 软件测量蛋白条带的强度并生成标准曲线,从而确定样品中抗体蛋白含量与总蛋白含量的比例。

二、工作流程时间线

第 1 天:进行 SDS-PAGE 并染色凝胶

第 1 天或之后:图像分析

三、设备

o 加热模块/金属浴

o 单道移液枪:1–10 µL, 2–20 µL, 20–200 µL, 200–1000 µL

o 移液管控制器

o 微量离心机

o 电泳槽

o 电源

o 摇床

o 通风橱

o 金属铲刀

o 刀片

o 塑料托盘

o 凝胶成像系统

o ImageJ 或类似图像分析软件

四、试剂

o 纯化重组抗体(0.9–1.1 mg/mL)

o SimplyBlue SafeStain(赛默飞,LC6060)

o 4-12% NuPage Novex bis-tris 迷你胶(1mm 厚,10 孔)

o 20X MOPS SDS 电泳缓冲液

o 4X NuPage 上样缓冲液

o 10X NuPage 样品还原剂(500 mM 二硫苏糖醇, DTT)

o PageRuler Plus 预染蛋白 Marker

o 移液枪吸头:10 µL, 20 µL, 200 µL, 1000 µL

o 移液管:5 mL, 10 mL, 25 mL, 50 mL

o 凝胶上样吸头

o 微量离心管

o PBS (1X, pH 7.4)

o 250 mL 无菌瓶

o 去离子水

o IgG 同型标准品 2.5 mg/mL(可使用商业标准品或验证过的内部标准品)

五、实验前准备

将加热模块预热至 100 °C。

在冰上解冻 IgG 标准品和预染蛋白 Marker。

六、试剂配制

1. 配制 IgG 标准品

o 用 PBS 稀释 2.5 mg/mL 的 IgG 同型标准品,配制如下浓度:

1.5 mg/mL:18 µL 的 2.5 mg/mL 标准品 + 12 µL PBS

1.0 mg/mL:20 µL 的 1.5 mg/mL 标准品 + 10 µL PBS

0.75 mg/mL:15 µL 的 1.0 mg/mL 标准品 + 5 µL PBS

0.5 mg/mL:13.3 µL 的 0.75 mg/mL 标准品 + 6.7 µL PBS

0.25 mg/mL:10 µL 的 0.5 mg/mL 标准品 + 10 µL PBS

0.125 mg/mL:10 µL 的 0.25 mg/mL 标准品 + 10 µL PBS

o 将 5 µL 的每种标准品转移至微量离心管中。

o 加入 8 µL PBS,使总体积达到 13 µL。

2. 配制重组抗体样品

o 将纯化的重组抗体稀释或浓缩至 0.9–1.1 mg/mL。

o 将 5 µL 重组抗体转移至微量离心管中。

o 加入 8 µL PBS,使总体积达到 13 µL。

3. 配制 1X MOPS 缓冲液

o 将 25 mL 的 20X MOPS 缓冲液加入 475 mL 去离子水中稀释。

o 轻轻颠倒混匀。

七、实验步骤

第一部分:SDS-PAGE 电泳

1. 向每个样品中加入 5 µL 的 4X 上样缓冲液。

2. 向每个样品中加入 2 µL 的 10X 还原剂。

3. 在微量离心机中短暂离心样品。

4. 在 100 °C 的加热模块中加热样品 10 分钟。

5. 在微量离心机中短暂离心样品。

6. 从塑料包装中取出凝胶,用去离子水冲洗。

7. 轻轻撕掉凝胶底部的白色贴纸。

8. 将凝胶放入电泳槽并固定好。

专业提示:如果不确定凝胶的正确方向,请查阅制造商的说明书。

9. 小心地从凝胶中拔出梳子。

10. 用 200 µL 的 1X MOPS 电泳缓冲液冲洗每个加样孔。

11. 向电泳槽中加满 1X MOPS 电泳缓冲液。

12. 确保电泳槽密封良好。

13. 向相应的孔中加入 5 µL 预染蛋白 Marker。

专业提示:如果可能,在上样样品前空出一个泳道。

14. 向相应的孔中加入 20 µL 的每种重组抗体样品。

专业提示:在样品之间留出清晰的空泳道将使凝胶定量更容易。

15. 盖上电泳槽盖子并连接电源。

16. 在 150 V 电压下电泳 1 小时。

专业提示:如果样品跑得不均匀且染料前沿看起来像“笑脸”,请降低电压。

17. 关闭电源并拔掉电泳槽插头。

18. 从电泳槽中取出凝胶。

19. 使用金属铲刀轻轻撬开凝胶夹板。

20. 使用刀片切掉顶部的加样孔部分和底部可见染料的凝胶部分。

第二部分:凝胶染色

21. 将凝胶放入装有 100 mL 去离子水的塑料托盘中。

22. 在摇床上轻轻晃动,用去离子水冲洗凝胶 5 分钟。

23. 将水倒入水槽倒掉。

24. 加入 20 mL SimplyBlue SafeStain 染色液,在摇床上轻轻晃动孵育 1 小时。

25. 将染色液倒入水槽倒掉。

26. 加入 100 mL 去离子水,在摇床上轻轻晃动孵育 1 小时。

27. 将水倒入水槽倒掉。

28. 加入 100 mL 去离子水,在摇床上轻轻晃动孵育 1 小时。

29. 将水倒入水槽倒掉。

30. 使用合适的成像系统拍摄凝胶的明场图像。

凝胶染色示例

图 1:凝胶染色示例

重组抗体制备样品应在约 50 kDa 和 25 kDa 处有两条清晰的条带,分别对应重链(HC)和轻链(LC)蛋白。背景染色应非常少。

专业提示:条带电泳迁移率发生较大偏移(如图 1 中的样品 AR0016)表明样品在细胞内可能未被正确处理(例如,未能切除信号肽),可能不具备功能。该样品将无法通过质检,因此不予使用。

第三部分:图像分析

31. 使用 ImageJ 或类似的图像软件确定蛋白条带相对于整个泳道的相对强度。

32. 将凝胶图像导入 ImageJ:选择 File(文件) -> Open(打开) -> 选择文件位置。

33. 将图像类型更改为 8-bit(8位):选择 Image(图像) -> Type(类型) -> 8-bit。

34. 确定凝胶的每个泳道(如图 2 所示):

图像分析示例

图 2:图像分析示例1

o 使用矩形工具,在第一个凝胶泳道周围画一个框。

o 选择 Analyze(分析) -> Gels(凝胶分析) -> Select First Lane(选择第一泳道)。

o 将框拖动到下一个泳道。

o 选择 Analyze(分析) -> Gels(凝胶分析) -> Select Next Lane(选择下一泳道)。

o 对所有泳道重复此操作。

35. 绘制蛋白条带的峰下面积曲线(如图 3 所示):

图像分析示例

图 3:图像分析示例2

o 选择 Analyze(分析) -> Gels(凝胶分析) -> Plot Lanes(绘制泳道曲线)。

36. 每个泳道将出现一个图表,其中的峰值代表每个蛋白条带。

37. 使用直线工具连接每个峰的底部。

38. 选择魔棒工具。

39. 通过选择每个峰的中心来填充每个峰。

40. 将结果导出为 csv 文件:在结果表中,选择 File(文件) -> Save As(另存为)。

41. 计算样品的纯度百分比:

计算样品的纯度百分比公式

图 4:计算样品的纯度百分比公式

其中:P = 纯度 (%);H = 重链(HC)峰面积;L = 轻链(LC)峰面积;A = 泳道中所有条带的总面积

如AR0018 样品示例(图 1 中的泳道 2):

样品峰 1 (杂质)峰 2 (杂质)峰 3 (重链 HC)峰 4 (轻链 LC)总面积HC + LC 面积纯度
AR0018310.142207.97111469.2964655.11316642.52216124.40996.887%

纯度 = (HC + LC 面积) / 总面积 × 100% = 96.887%

专业提示:以上为仅使用纯度 ≥90% 的重组抗体制备样品,但有些实验室常规使用未纯化的组织培养上清液也未出现任何问题。

42. 在电子表格软件中,绘制 IgG 标准品的 mg/mL 浓度与 HC + LC 面积的关系图:

o 打开导出的 CSV 文件并导入数据。

o 选择“插入”选项卡,然后点击“图表”。

o 在图表编辑器中,将图表类型选择为“散点图”。

o 更改数据范围,选择代表 X 轴和 Y 轴的单元格。

43. 为标准品添加线性趋势线:

o 在图表编辑器中,选择“自定义”选项卡。

o 选择“系列”下拉菜单。

o 勾选“趋势线”复选框。

44. 确定趋势线的线性方程和 R² 值:

o 在“自定义”选项卡中,选择“标签”下拉菜单并选择“使用方程”。

o 勾选“显示 R²”复选框。

专业提示:趋势线的 R² 值应介于 0.95 到 1 之间。

45. 使用趋势线方程根据样品的 HC + LC 面积确定样品的浓度。

o 计算示例:

如果样品的 HC + LC 面积为 18179.442,标准曲线的线性方程为 y = 14725x + 3748.4,则将 18179.442 代入 y 并求解 x。

18179.442 = 14725x + 3748.4

x = 0.980

该样品的浓度为 0.980 mg/mL。

参考文献与相关资料

https://www.addgene.org/

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更新日期:2026-05-29

编制人:磊子

审稿人:叶凡