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海洋中采集水和沉积物样本,发现海洋细菌

来源:武汉市灰藻生物科技有限公司   浏览量:26   发布时间:2025-12-29 14:15:43


本规程旨在展示在海洋科考船上开展海水与沉积物采样的策略,所获取的样品可用于鉴定与海水和沉积物相关的海洋细菌(marine bacteria)

1. 健康与安全(Health and Safety)

注意:确保配备甲板作业所需的个人防护装备(PPE),包括连体工作服(overalls)麂皮手套(suede gloves)安全头盔(helmet)安全护目镜(goggles)防眩光太阳镜(sunglasses)

由于甲板作业强度较大,保持充分水分摄入(adequate hydration)至关重要

2. 抵达采样点(Arriving at the Sampling Point)

抵达预定采样站后,按照航次计划(cruise plan)部署设备。每个采样站以其地理坐标(geographical position)水深(depth)标识。
到达指定采样站后,下放
SBE 9plus-Seabird 温盐深剖面仪(Conductivity, Temperature, and Depth profiler, CTD),至距海底约50米高度处。

设备部署

图1 设备部署

在电子日志与纸质日志中记录设备下放、触底及回收过程的相关信息,并补充任何额外备注。

设备回收至甲板后,准备部署序列中的下一套设备。

3. 部署 PNF-300 荧光计(Fluorometer)

使用 PNF-300 荧光计(fluorometer)获取水柱(water column)的荧光剖面图,以识别叶绿素最大值层(maximum fluorescence peak)

确保在部署前取下荧光传感器(fluorometer sensors)的保护帽

回收荧光计后,重新盖上传感器保护帽。

4. 海底地形测绘

利用 Kongsberg EM302 多波束测深系统(Multibeam Echosounder system)确定海底深度与地形。

5. 海洋环境采样:海水(Sea Water Sampling)

根据站点特征化(site characterization)后的深度数据,确定具体采样目标区域。
该过程耗时因站点水深差异而显著不同。例如,在3800米水深处,整个流程可能长达2小时。设备以约1米/秒的速度下放与回收,但在采集水样前需短暂稳定数秒。

使用配备12个10升Niskin PVC采水瓶SBE 32–Seabird 自动采水器(Carousel)进行海水采样。采水器下放时所有瓶口开启,到达预设深度后通过远程控制依次关闭各瓶。

水样收集

图2 水样收集

最先关闭的是最深水层的采水瓶,标记为“底层(bottom)”,并作为背景对照(background)

在采水器上浮过程中,按需在特定深度(如1500米、1000米、500米及表层)依次关闭采水瓶。每次操作均需在日志本中记录时间、坐标及对应瓶号

6. 船甲板上的海水收集(Water Collection on Deck)

所有采水瓶关闭后,将采水器吊运至甲板并固定稳妥

7. 按采样点分配顺序取样

依据各采样点对应的瓶号顺序进行样品分装。

8. 将连接至各Niskin瓶出水口的软管小心插入预先标记好的20升收集瓶中。

水样收集

图3 水样收集

表层(约5米)与底层(约3600米)水样被运送至船上实验室

使用真空泵(vacuum pump)通过孔径为0.22 µm的滤膜(filters)对约15升海水进行过滤。

无菌铝箔包裹富集了微生物生物量(biomass)的滤膜,并外覆封口膜(parafilm)

部分滤膜于4°C保存以备后续分析,另一部分则置于液氮(liquid nitrogen)中速冻保存。所有滤膜均运回实验室。

9. 海洋环境采样:沉积物(Sediment Sampling)

若因船舶漂移(drifting)导致位置偏移,需重新定位至同一地理坐标进行多次沉积物采样。

水样收集

图4 水样收集

在投放多管采泥器(multicorer)前,须严格执行完整安全规程,以保障操作安全并确保成功获取样品。
沉积物采样耗时受多种因素影响,包括站点水深、当时气象条件、设备在水柱中的下放/稳定/回收性能、海底底质特性及设备回收情况等。

绞车(winch)下放多管采泥器的速度依海况调整。多波束系统(multibeam system)穿透式测深仪(penetration echosounder)提供的数据用于判断海底性质,并评估成功获取全部岩芯(cores)的可能性。

通过缆绳张力(cable tension)监测设备下放过程及触底状态。

多管采泥器回收至甲板后,先将其固定,再逐一拆卸岩芯管。
:若因恶劣天气导致采样失败,需在同一站点重复采样,并重新定位科考船。

10. 岩芯处理与记录

每根岩芯在拆卸前均需拍照并记录信息。逐根标识后从主架上拆下,立即用橡胶塞(rubber caps)封住顶部与底部,防止底层水(bottom water)或沉积物流失。随后将岩芯置于专用岩芯架(core rack)中,以便后续处理。根据研究需求,岩芯可在低温室(cold room)、实验室或甲板上处理。

将岩芯逐根放置于岩芯架,运送至指定处理区域。

岩芯处理可由一人或两人协作完成,视人员能力与经验而定。若需分层切割,可将岩芯底部放入挤出装置(extruder);否则无需使用。若研究关注底层水,则需提前规划其保存方案。根据研究目标不同,所需辅助工具亦有差异:
- 若研究
微塑料(plastics),应避免使用塑料制工具、手套、挤出器、容器、软管及橡胶塞
- 若研究
金属(metals),则应避免使用任何金属工具切割沉积物
- 若研究
有机质或微生物(microbiology),须严防交叉污染(transcontamination),清洗与筛分时应使用过滤水(filtered water),避免混入水柱生物。

岩芯处理

图5 岩芯处理

取下岩芯两端塞子时需稳固操作,防止底层水或沉积物泄漏,以免扰动沉积层界面、产生气泡或造成倾斜,影响层序完整性。沉积物样品的质量控制(quality control)对获得可靠结果至关重要

各沉积层的采样深度由具体研究目标决定。可借助预切环(precut rings)或定量挤出法确保切片厚度均匀。每层样品应置于预先标记的玻璃或塑料容器/袋中,材质选择需基于研究性质,以避免交叉污染并保障样品质量。对于深海样品,建议尽快处理,以减少升温及阳光照射(sunlight exposure)带来的影响

此处展示一种分层采样示例:沉积物储存于玻璃罐(glass jars)中。

分层采样示例

图6 分层采样示例

11. 样品记录与保存

所有样品均详细记录,并根据需要进行固定,随后存放于船上冷库(cold room)或实验室。

12. 沉积物分样(Subsampling)

对已获取的沉积物进行分样:
- 一份(约适量)置于
带盖玻璃容器中,4°C保存
- 另一份(30克)装入
无菌Falcon离心管(50 mL, Fisher Scientific),浸入液氮保存。
分样时可使用
无针头手持注射器(hand-held syringes without tip),以避免扰动沉积层序。

13. 剩余沉积物处理

剩余沉积物可由其他团队成员使用、捐赠用于艺术创作,或按规定归还大海。

14. 设备清洁

采泥管(corers)与多管采泥器(multicorer)使用后必须彻底清洗,这是最佳海洋实践(best ocean practices)之一,可有效防止不同采样点之间的交叉污染及生境干扰。

设备清洁

图7 设备清洁

15. 实验室储存(Laboratory Storage)

从液氮罐中谨慎取出样品。
注意液氮(liquid nitrogen)温度极低,操作时务必小心!

16. 长期保存

将样品转移至研究所实验室的超低温冰箱(ultra-freezer)中,于–80°C条件下长期保存。

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更新日期:2025-12-26

编制人:磊子

审稿人:小藻