硫荚菌属 、硫球菌属和囊硫菌属系统分类学、生理生态特征及菌种保藏方法（第二卷 变形菌门 Part B, Page 54））

硫荚菌属 (Thiocapsa)

细胞形态：球形细胞直径1.0–3.0微米(μm)，二分裂繁殖前呈双球菌状，无运动性。经两个垂直平面连续分裂后可形成四联体。

单个细胞由坚固粘液荚膜包裹，可能含气泡。革兰氏阴性，属于γ-变形菌纲，具囊状内光合膜系统，含光合色素细菌叶绿素a和类胡萝卜素。

代谢特性：在厌氧光照条件下可实现光能自养生长，以硫化物、硫代硫酸盐和硫磺作为电子供体。亦可利用氢气。

硫化氢氧化过程中产生的硫单质(S0)以高折光性球体形式暂存胞内，最终氧化产物为硫酸盐。在硫化物和碳酸氢盐共存时，可光同化简单有机底物。

部分物种能在微氧至有氧黑暗条件下通过化能自养或化能异养生长。

储存物质包括：多糖、聚-β-羟基丁酸酯、硫单质(S0)、多聚磷酸盐。可能需要维生素B12。DNA的GC含量为63.3–66.3 mol%。

模式种：桃红荚硫菌(Thiocapsa roseopersicina) Winogradsky 1888, 84。

在不利生长条件下，硫荚菌属（Thiocapsa）物种可形成嵌于粘液中的细胞聚集体，此特性与囊硫菌属（Thiocystis）、异着色菌属（Allochromatium）和Marichromatium属物种相似。

硫荚菌属物种的细胞直径会因培养条件不同而显著变化。

当前已知物种中，玫瑰色硫荚菌（Thiocapsa rosea）和悬浮硫荚菌（Thiocapsa pendens）含气泡（gas vesicles），而桃红荚硫菌（Thiocapsa roseopersicina）不含该结构。

桃红荚硫菌见于淡水、半咸水和海洋生境，其对低盐浓度适应性强，能在上述三类环境中发育并成功竞争。但序列对比分析表明，从海洋分离且暂归本种的若干菌株可能在物种层面存在区分。这些细菌对低盐浓度耐受性强，可视为耐盐菌(halotolerant)而非嗜盐菌(halophilic)。

一、硫荚菌属 (Thiocapsa) 富集与分离方法

方法同着色菌属(Chromatium)。桃红荚硫菌是自然界最常见的紫色硫细菌之一，特别富集于接收有机质污水或废水的池塘、水池和泻湖。

因其是已知最易培养的紫色硫细菌，分离无特殊困难。其余物种（悬浮硫荚菌和玫瑰色硫荚菌）可通过琼脂摇瓶稀释培养法直接从自然样本中分离，操作同着色菌属。

琼脂菌落呈特征粉红色，含气泡的悬浮硫荚菌和玫瑰色硫荚菌菌落始终维持白垩状外观（即使细胞无硫粒）。

二、硫荚菌属 (Thiocapsa) 菌种保藏

液态培养基传代保存及液氮长期保存方法同着色菌属。

三、硫荚菌属 (Thiocapsa) 属间鉴别

与着色菌科(Chromatiaceae)其他光养属的鉴别特征参见着色菌科章节表7。本属细胞可能形成四联体，易与玫瑰色平盘菌(Thiopedia rosea)或 Thiolamprovum pedioforme 混淆，但后两者可通过通常由8、16或更多规则排列细胞形成的平板状聚集体区分。

其他表型鉴别特征列于着色菌科章节表7。

基于16S rDNA序列的系统发育关系见着色菌科章节图2。

四、硫荚菌属 (Thiocapsa) 分类学评注

既往将无气泡、不运动球形紫色硫细菌均归入硫荚菌属。遗传分析表明，原归本属的三个物种中，嗜盐硫荚菌(Thiocapsa halophila)和普氏硫荚菌(Thiocapsa pfennigii)与模式种桃红荚硫菌系统发育距离远，两者属于海洋色谱科物种聚类（见着色菌科章节图1和2），故已移出本属，分别重新命名为普氏硫球菌(Thiococcus pfennigii)和嗜盐硫荚菌(Thiohalocapsa halophila)。

而玫瑰色硫荚菌和悬浮硫荚菌（原称玫瑰形变形杆菌Amoebobacter roseus和悬浮变形杆菌Amoebobacter pendens）与桃红荚硫菌遗传关系密切，故归入本属。

由于变形杆菌属(Amoebobacter)与硫荚菌属的模式种合并，根据《国际细菌命名法规》规则42，选择硫荚菌属作为属名（因其知名度更高且命名更适切），保留桃红荚硫菌作模式种。原变形杆菌属其余物种据此重新分类（参见Thiolamprovum和Lamprocystis属）。

五、硫荚菌属 (Thiocapsa) 物种鉴别特征

I. 细胞无气泡，具同化型硫酸盐还原能力，可利用氢作为电子供体

——桃红荚硫菌(T. roseopersicina)

II. 细胞含气泡，无同化型硫酸盐还原能力，不可利用氢作为电子供体

A. 能在微氧黑暗条件下生长，不可利用葡萄糖

——玫瑰色硫荚菌(T. rosea)

B. 不能在微氧条件下生长（严格厌氧），可利用葡萄糖

——悬浮硫荚菌(T. pendens)

六、硫荚菌属（Thiocapsa）物种列表

种名词源：拉丁语形容词roseus意为玫瑰色；希腊语名词persicus意为桃子；现代拉丁语阴性形容词roseopersicina意为桃红色。

细胞球形，直径1.2–3.0微米，通常为1.5微米（图1），具有坚固的粘液荚膜。常见二联、四联或多细胞聚集体；不规则细胞团通常被粘液包裹。无气泡。单细胞无色，细胞悬液呈粉红至玫瑰红色。

光合色素为细菌叶绿素a和正常螺菌黄素类群的类胡萝卜素。

图1. 以硫化物为底物光能自养培养的桃红荚硫菌（Thiocapsa roseopersicina DSM 219）。相差显微照片。比例尺：5 μm。

在厌氧光照条件下可进行光能自养生长，以氢气、硫化物、硫代硫酸盐和硫作为电子供体。

可光同化乙酸、丙酮酸、富马酸、苹果酸、琥珀酸、甘油和果糖。不利用乳酸、丙酸、丁酸、酒石酸、α-酮戊二酸、柠檬酸、苯甲酸及醇类。

可在微氧至有氧黑暗条件下进行化能自养或化能异养生长。大多数菌株具有同化型硫酸盐还原能力。氮源为铵盐。具有固氮酶活性。不需要生长因子。

中温菌，最适生长温度20–35℃，最适pH 7.3（pH范围6.5–7.5）。

生境：含有可降解有机物质和硫化物的池塘、水池或废水泻湖的静水及淤泥中；常见于河口和盐沼。

DNA的G+C含量为63.3–66.3 mol%（浮力密度法）；模式菌株为65.3 mol%。

模式菌株：1711, BN 4210, DSM 217。

GenBank登录号（16S rRNA）：Y12364。

2. 海岸硫荚菌（Thiocapsa litoralis）Puchkova, Imhoff and Gorlenko 2000, 1446VP

种名词源：拉丁语形容词litoralis意为海岸的。

细胞球形，不运动，直径1.5–2.5微米，规则排列成4、8、16或更多细胞的平板状聚集体。光合膜为囊泡型。细胞悬液呈粉红至玫瑰红色。光合色素为细菌叶绿素a，很可能还有螺菌黄素系列的色素。

在厌氧光照下可进行光养生长，在微氧黑暗条件下可进行化能自养生长。光自养生长的电子供体包括硫化氢、元素硫、硫代硫酸盐和亚硫酸盐。

元素硫以球体形式作为中间产物储存于细胞内。在硫化物和碳酸氢盐存在时，可光同化乙酸、丙酸、丁酸、戊酸、丙酮酸、乳酸、苹果酸、琥珀酸、富马酸、果糖、葡萄糖、酪蛋白氨基酸和酵母提取物。

不利用辛酸、酒石酸、甲酸、抗坏血酸、天冬酰胺、苯甲酸、丙二酸、柠檬酸、麦芽糖、半乳糖、甘露醇、山梨醇、甘油、甲醇和乙醇。具有同化型硫酸盐还原能力。

以硫化氢和硫代硫酸盐为电子供体时可进行化能无机自养生长。需要维生素B12作为生长因子。储存物质包括聚-β-羟基丁酸酯和多聚磷酸盐。

中温菌，最适生长条件：pH 6.5、30℃、1%氯化钠。

生境：白海滨海沿岸的微生物垫群落。

DNA的G+C含量为64.0 mol%（熔解温度法）。

模式菌株：BM5, ATCC 700894。

GenBank登录号（16S rRNA）：AJ24772。

3. 悬浮硫荚菌（Thiocapsa pendens） (Molisch 1906) Guyoneaud等 1998b, 962VP （异名：Amoebobacter pendens (Molisch 1906) Pfennig和Trüper 1971b, 13；Rhodothece pendens Molisch 1906, 230）

种名词源：拉丁分词形容词pendens意为悬挂。

细胞球形，直径1.5–2.0微米，有时可达2.5微米。单个细胞被粘液荚膜包裹，形成大小不规则的细胞聚集体。

由于大量粘液形成，培养基变得粘稠。含气泡。单细胞无色，细胞悬液呈粉红至玫瑰红色。光合色素为细菌叶绿素a和螺菌黄素类群的类胡萝卜素，其中螺菌黄素为主要成分。

严格厌氧且专性光养。在微氧至有氧黑暗条件下不生长。厌氧光照下可进行光能自养生长，以硫化物、硫代硫酸盐、亚硫酸盐和硫作为电子供体。

仅可光同化乙酸、丙酮酸、丙酸、乳酸、苹果酸和葡萄糖。无同化型硫酸盐还原能力。氮源为铵盐。生长需要维生素B12。

中温淡水菌，最适生长温度20–35℃，pH范围6.7–7.5。

生境：暴露于光照的含硫化物淡水静水及淤泥中。

DNA的G+C含量为65.3 mol%（浮力密度法）。

模式菌株：DSM 236（新模式菌株）。

GenBank登录号（16S rRNA）：AJ002797。

4. 玫瑰色硫荚菌（Thiocapsa rosea） (Winogradsky 1888) Guyoneaud等 1998b, 962VP（异名：Amoebobacter roseus Winogradsky 1888, 77）

种名词源：拉丁阴性形容词rosea意为玫瑰色。

细胞球形，直径2.0–3.0微米。单个细胞及不规则细胞聚集体被粘液包裹。含气泡。单细胞无色，细胞悬液呈粉红至玫瑰红色。光合色素为细菌叶绿素a和螺菌黄素类群的类胡萝卜素，其中螺菌黄素为主要成分。

厌氧光照下可进行光能自养生长，以硫化物、硫代硫酸盐和硫作为电子供体。

可光同化乙酸、丙酮酸、丙酸、乳酸、苹果酸、果糖和酪蛋白氨基酸。不利用其他糖类、醇类、其他脂肪酸、琥珀酸、酒石酸、苯甲酸或柠檬酸。

可在微氧至有氧黑暗条件下进行化能自养或混合营养生长。无同化型硫酸盐还原能力。氮源为氨。需要维生素B12。

中温淡水菌，最适生长温度20–35℃，pH范围6.7–7.5。

DNA的G+C含量为64.3 mol%（浮力密度法）。

模式菌株：DSM 235。

GenBank登录号（16S rRNA）：AJ002798, AJ006062。

注：第2种海岸硫荚菌（Thiocapsa litoralis）的生境补充：白海滨海沿岸的微生物垫群落。

DNA的G+C含量为64.0 mol%（熔解温度法）。

模式菌株：BM5, ATCC 700894。

GenBank登录号（16S rRNA）：AJ24772。

硫球菌属（Thiococcus）

细胞特征：细胞球形，分裂期呈双球菌形态，无运动性，通过二分裂繁殖。

革兰氏阴性，属于γ-变形菌纲，具有由带状分支管束组成的内部光合膜系统，这些膜系统与细胞质膜相连。单细胞无色，细胞悬液呈黄至橙褐色。光合色素为细菌叶绿素b和类胡萝卜素。

代谢特性：专性光养且严格厌氧。在厌氧光照条件下，以硫化物和硫单质（S0）为电子供体进行光能自养生长。

硫化氢氧化过程中，硫单质以高折光性球体形式暂存胞内，最终氧化产物为硫酸盐。在硫化物和碳酸氢盐共存时，可光同化简单有机底物。

中温菌，最适生长温度20-35℃，最适中性pH（范围6.5-7.5）。可能需要盐分以达到最佳生长。DNA的G+C含量为69.4-69.9 mol%。

模式种：普氏硫球菌（Thiococcus pfennigii）（Eimhjellen 1970）Imhoff等 1998b, 1139（异名：Thiocapsa pfennigii Eimhjellen 1970, 193）

一、硫球菌属（Thiococcus） 富集与分离方法

普氏硫球菌是着色菌科（Chromatiaceae）中迄今唯一已知含细菌叶绿素b的物种。

因该色素特性，其活体细胞在红外光谱区（1020-1030 nm）具有最大吸收峰。

通过选择性滤光技术，利用此特性可实现该菌的选择性富集培养。其他培养条件和分离方法与着色菌属（Chromatium）相同。若需使用着色菌属培养基，应补充1-3%氯化钠（NaCl）。

二、硫球菌属（Thiococcus） 菌种保藏

液态培养基传代保存及液氮长期保存方法同着色菌属。

三、硫球菌属（Thiococcus） 属间鉴别

与着色菌科其他光养属的鉴别特征参见着色菌科章节表6。基于16S rDNA分析的系统发育关系见着色菌科章节图1。

四、硫球菌属（Thiococcus） 分类学评注

本属名Thiococcus由Eimhjellen等（1967）首次提出，但未有效发表，后该菌被正式命名为Thiocapsa pfennigii（Eimhjellen，1970）。

因普氏硫球菌与硫荚菌属（Thiocapsa）成员存在显著遗传和表型差异，故将其转入新属并恢复硫球菌属名称。

潜在新模式菌株（DSM 226, Trüper 8013, Imhoff 4250）属于海洋色谱科物种聚类，生长至少需要1% NaCl。

该菌的盐依赖性及自然分布尚不明确：原始模式菌株分离自淡水（河水）但已遗失；后续分离菌株来源包括淡水和海洋环境，但尚未完成全部菌株的化学分类学、遗传学分析及盐依赖性测定。

五、硫球菌属（Thiococcus）物种列表

1. 普氏硫球菌（Thiococcus pfennigii） (Eimhjellen 1970) Imhoff, Süling and Petri 1998b, 1139VP（异名：Thiocapsa pfennigii Eimhjellen 1970, 193）

种名词源：以德国微生物学家N. Pfennig的名字命名。

细胞球形，直径1.2–1.5微米；分裂期呈双球菌形态，长约2.5微米；稳定期细胞直径0.8–1.0微米。

内部光合膜系统为由带状分支管束组成的膜系统，与细胞质膜相连。单细胞无色，细胞悬液呈黄至橙褐色。光合色素为细菌叶绿素b和类胡萝卜素3,4,3,4-四氢螺菌黄素。

专性光养且严格厌氧。以硫化物和硫单质为电子供体进行光能自养生长。

在硫化物和碳酸氢盐存在时，可光同化乙酸、丙酮酸、丙酸、乳酸、富马酸、琥珀酸、苹果酸和果糖。不利用硫代硫酸盐和丁酸。氮源为铵盐和氮气。

中温菌，最适生长条件：0.5–2%氯化钠、20–35℃、pH 7.0（范围6.5–7.5）。

生境：暴露于光照的含硫化物的淡水、半咸水和海洋水体及沉积物中。

DNA的G+C含量为69.4–69.9 mol%（浮力密度法）。

模式菌株：DSM 1375（RG3, Nidelven）已遗失；未指定新模式菌株。

GenBank登录号（16S rRNA）：Y12373（菌株DSM 226）。

补充说明：菌株BN 4254（Pfennig 8320）的GenBank登录号为AJ010125。

囊硫菌属（Thiocystis）

细胞特征：细胞呈杆状、卵圆形或球形，分裂前常呈双球菌形态，借鞭毛运动，单生或成对出现；可形成被粘液包裹的不规则聚集体，通过二分裂繁殖。

革兰氏阴性，属于γ-变形菌纲，具有囊泡状内光合膜系统，含光合色素细菌叶绿素a和类胡萝卜素。

代谢特性：在厌氧光照条件下，以硫化物和硫单质（S0）为电子供体进行光能自养生长。亦可利用硫代硫酸盐和氢气。

硫化氢氧化过程中，硫单质以高折光性球体形式暂存胞内，最终氧化产物为硫酸盐。在硫化物和碳酸氢盐存在时，可光同化简单有机底物。

部分物种能在微氧至有氧黑暗条件下进行化能自养或化能有机营养生长。储存物质包括：多糖、聚-β-羟基丁酸酯、硫单质（S0）和多聚磷酸盐。

广布的中温菌，最适生长温度25–35℃，pH 6.5–7.6，可从淡水、半咸水和海洋环境中分离。

生境：暴露于光照的含硫化物厌氧水体及淤泥环境，包括淡水池塘湖泊、半咸水与海洋生境。

DNA的G+C含量为61.3–67.9 mol%。

模式种：紫色囊硫菌（Thiocystis violacea）Winogradsky 1888, 65。

补充描述：本属物种常与异色菌属（Allochromatium）共存于相同自然生境，两属细菌具有诸多共同生理特性，不仅表现在还原性硫化合物和有机底物的光养代谢，还包括部分物种在微氧至有氧黑暗条件下的兼性化能自养或化能有机营养代谢。

一、囊硫菌属（Thiocystis） 富集与分离方法

培养基及培养条件同着色菌属（Chromatium）。

二、囊硫菌属（Thiocystis） 菌种保藏

液态培养基传代保存及液氮长期保存方法同着色菌属。

三、囊硫菌属（Thiocystis） 属间鉴别

根据16S rDNA序列分析，本属属于着色菌科（Chromatiaceae）中运动性淡水物种分支。与着色菌科其他光养属的鉴别特征参见着色菌科章节表5，系统发育关系见着色菌科章节图1。

四、囊硫菌属（Thiocystis） 分类学评注

既往根据球形形态、鞭毛运动性和无气泡等特征区分本属与着色菌科其他属。Winogradsky（1888）曾根据硫球位置差异建立动性球形紫色硫细菌第二属——硫囊菌属（Thiothece）：

其硫球位于细胞近内周，而囊硫菌属硫球随机分布。后因认为两属并存缺乏依据，将胶质硫囊菌（Thiothece gelatinosa）归入本属。

16S rRNA寡核苷酸目录相似性研究和全16S rDNA序列分析不仅证实胶质囊硫菌与紫色囊硫菌的亲缘关系，还揭示其与微小囊硫菌（原名微小色菌Chromatium minus）和紫闪囊硫菌（原名紫闪色菌Chromatium violascens）的高度遗传相关性。

五、囊硫菌属（Thiocystis） 物种鉴别特征

（参见着色菌科章节表5）

I. 细胞球形

A. 硫球随机分布于胞内，含玫红醛类（rhodopinal group）类胡萝卜素，菌株紫罗兰色

——紫色囊硫菌（T. violacea）

B. 硫球仅位于细胞近内周，含奥酮类（okenone group）类胡萝卜素，菌株紫红色

——胶质囊硫菌（T. gelatinosa）

II. 细胞杆状

A. 含奥酮类类胡萝卜素，仅利用乙酸、丙酮酸和葡萄糖

——微小囊硫菌（T. minor）

B. 含玫红醛类类胡萝卜素，可利用氢但不利用糖类

——紫闪囊硫菌（T. violascens）

六、囊硫菌属（Thiocystis）物种列表

1. 紫色囊硫菌（Thiocystis violacea） Winogradsky 1888, 65AL

种名词源：拉丁阴性形容词violacea意为紫罗兰色。

细胞球形，直径约2.5–3微米（μm）。培养条件变化时可能出现较大个体。不利条件下形成被粘液包裹的不规则聚集体。硫球随机分布于胞内（图2）。

单细胞灰白色，细胞悬液紫罗兰色。光合色素为细菌叶绿素a和玫红醛类类胡萝卜素（Schmidt等，1965）。

图2.以硫化物为底物光能自养培养的紫色囊硫菌（Thiocystis violacea DSM 207）。细胞内含硫球。明视野显微照片。比例尺：5 μm。

在厌氧光照下以硫化物、硫、硫代硫酸盐、亚硫酸盐（部分菌株）和氢气为电子供体进行光自养生长。

硫化物和碳酸氢盐存在时，可光同化乙酸、丙酮酸和富马酸；部分菌株还能利用丙酸、琥珀酸、酮戊二酸、葡萄糖、果糖、丙醇或甘油。

微氧至有氧黑暗条件下可进行化能自养或混合营养生长。部分菌株具同化型硫酸盐还原能力。氮源：铵盐、尿素和氮气。

中温菌，最适生长温度25–35℃，pH 7.0–7.3（范围6.5–7.6）。海洋分离株可耐受或需低浓度氯化钠。

生境：含硫化物的淡水、半咸水或海水池塘湖泊；污水泻湖、河口、盐沼和硫泉。

DNA的G+C含量：62.8–67.9 mol%（浮力密度法，Bd）；模式菌株63.1 mol%（Bd）。

模式菌株：2711, BN 4340, DSM 207。

GenBank登录号（16S rRNA）：Y11315。

2.胶质囊硫菌（Thiocystis gelatinosa） (Winogradsky 1888) Pfennig and Trüper 1971b, 11AL（异名：Thiothece gelatinosa Winogradsky 1888, 82）

种名词源：拉丁分词形容词gelatus（凝固）；现代拉丁语名词gelatinum（明胶）；现代拉丁语阴性形容词gelatinosa（胶质的）。

细胞球形，直径约3微米。不利条件下可出现卵圆形细胞。高硫化物浓度（4–6 mM）和光照强度（≥1000 lux）下细胞失去运动性，形成粘液包裹的不规则聚集体。

最适生长条件下，硫球仅分布于细胞质外周（图3）。单细胞淡粉色，细胞悬液紫红色。光合色素为细菌叶绿素a和奥酮类类胡萝卜素。

图3. 在含硫化物培养基中进行光能自养培养的胶质硫囊菌（Thiocystis gelatinosa DSM 215）。部分细胞中硫珠的周边沉积现象清晰可见。明视野显微照片。比例尺 = 5 μm。

厌氧光照下以硫化物和硫为电子供体进行光能自养生长。硫化物和碳酸氢盐存在时可光同化乙酸和丙酮酸。微氧至半有氧条件下可进行化能自养或混合营养生长。氮源：铵盐。

中温菌，最适生长温度30℃，pH 7.0–7.3（范围6.5–7.6）。模式菌株需1%氯化钠。

生境：含硫化物的静水，分层湖的均温层。

DNA的G+C含量：61.3 mol%（Bd）。

模式菌株：2611, BN 4310, DSM 215。

GenBank登录号（16S rRNA）：Y11317。

3. 微小囊硫菌（Thiocystis minor） (Winogradsky 1888) Imhoff, Süling and Petri 1998b, 1139VP（异名：Chromatium minus Winogradsky 1888, 99）

种名词源：拉丁比较级阴性形容词minor（更小）。

细胞杆状，2×2.5–6微米，极生鞭毛。硫球均匀分布于胞内。单细胞无色至粉红色，细胞悬液紫红色。光合色素为细菌叶绿素a和奥酮。

厌氧光照下以硫化物、硫代硫酸盐和硫为电子供体进行光能自养生长。硫化物和碳酸氢盐存在时可光同化乙酸、丙酮酸和葡萄糖。

不利用：糖醇、醇类、高级脂肪酸、氨基酸、苯甲酸、甲酸及多数三羧酸循环中间体。微氧至半有氧条件下可进行化能自养或混合营养生长。无同化型硫酸盐还原能力。氮源：铵盐和氮气。

中温淡水菌，最适生长温度30℃，pH 7.0–7.3（范围6.5–7.6）。

生境：暴露光照的含硫化物淡水池塘湖泊。

DNA的G+C含量：62.2 mol%（Bd）。

模式菌株：1711, BN 5710, DSM 178。

GenBank登录号（16S rRNA）：Y12372。

4. 紫闪囊硫菌（Thiocystis violascens） (Perty 1852) Imhoff, Süling and Petri 1998b, 1139VP（异名：Chromatium violascens Perty 1852, 174）

种名词源：拉丁分词violascens（渐呈紫色）。

细胞杆状，2×2.5–6.0微米，偶见更长个体。细胞悬液紫罗兰色。光合色素为细菌叶绿素a和玫红醛类类胡萝卜素。

厌氧光照下以硫化物、硫、硫代硫酸盐、亚硫酸盐、氢气、甲酸、乙酸、丙酸和丙酮酸为电子供体进行光养生长。

部分菌株利用丁酸。不利用：糖类、糖醇、醇类、苯甲酸、柠檬酸和氨基酸。微氧至半有氧条件下可进行化能自养或混合营养生长。具同化型硫酸盐还原能力。氮源：铵盐和氮气。

中温菌（mesophilic），最适生长温度25–35℃，最适pH 7.0–7.3（范围6.5–7.6）。海洋分离株可能需要高达2%的氯化钠（NaCl）。

生境：暴露光照的含硫化物生境：淡水池塘湖泊、污水泻湖、半咸水、河口、盐沼和海洋环境。

DNA的G+C含量：61.8–64.3 mol%（Bd）；模式菌株62.2 mol%（Bd）。

模式菌株：6111, BN 5410, ATCC 17096, DSM 198。

GenBank登录号（16S rRNA）：AJ224438。

参考文献

1.Eimhjellen, K.E 1970. Thiocapsa pfennigii sp. nov., a new species of phototrophic sulfur bacteria. Arch. Microbiol. 73: 193–194.

2.Eimhjellen, K.E., Steensland, H. and Traetteberg, H. 1967. A Thiococcus sp. nov. gen., its pigments and internal membrane system. Arch. Microbiol. 59: 82–92.

3.Imhoff, J.F., Su¨ling, J. and Petri, R. 1998. Phylogenetic relationships among the Chromatiaceae, their taxonomic reclassification and description of the new genera Allochromatium, Halochromatium, Isochromatium, Marichromatium, Thiococcus, Thiohalocapsa, and Thermochromatium. Int. J. Syst. Bacteriol. 48: 1129–1143.

4.Guyoneaud, R, Su¨ling, J., Petri, R., Matheron, R., Caumette, P., Pfennig,N. and Imhoff, J.F. 1998. Taxonomic rearrangements of the genera Thiocapsa and Amoebobacter on the basis of 16S rDNA sequence analyses and description of Thiolamprovum gen. nov. Int. J. Syst. Bacteriol. 48:957–964.

5.Pfennig, N. and Tru¨per, H.G. 1971. New nomenclatural combinations in the phototrophic sulfur bacteria. Int. J. Syst. Bacteriol. 21: 11–14.

6.Taka´cs, B.J. and Holt, S.C. 1971. Thiocapsa floridana; a cytological physiological and chemical characterization. I. Cytology of whole cells and isolated chromatophore membranes. Biochim. Biophys. Acta 233:258–277.

# 翻译自：Bergeys Manual of Systematic Bacteriology (Garrity, Berner, Creig) . Volume Two：The Proteobacteria Part B The Gammaproteobacteria.（Order I. Chromatiales）

敬请关注“灰藻视界”，共筑健康未来！
— 武汉市灰藻生物科技有限公司团队敬上

灰藻生物：我们期待着与客户共同成长，共创生命科学的美好未来！

更新日期：2025-10-23

编制人：思琪

审稿人：小藻