基因组DNA提取技术手册:植物与动物组织的全面指南
来源:武汉市灰藻生物科技有限公司 浏览量:377 发布时间:2024-05-14 18:54:31
引言
在现代生物学研究中,基因组DNA的提取是基础且关键的一环,它为后续的遗传分析、基因功能研究、疾病诊断及生物技术应用提供了必要的物质基础。本文将概述从植物和动物组织中提取基因组DNA的方法。
一、从植物组织提取基因组DNA
1、实验材料
水稻幼苗或其他禾本科植物,李(苹果)幼嫩叶子。
2、实验设备
移液器,冷冻高速离心机,台式高速离心机,水浴锅,陶瓷研钵,50mL离心管(有盖)及5mL和1.5m离心管,弯成钩状的小玻璃棒。
3、实验试剂
(1)提取缓冲液Ⅰ 100mmol/LTris-HCl(pH8.0),20mmol/L EDTA,500mmol/L NaCl.,1.5% SDS。
(2)提取缓冲液Ⅱ 18.6g葡萄糖,6.9g二乙基二硫代碳酸钠,6.0gPVP(聚乙烯吡咯烷酮),240μL巯基乙醇,加水至300mL。
(3)氯仿:戊醇:乙醇(80:4:16)。
(4)RNaseA母液10μg/μL。
(5)其他试剂 液氮,异丙醇,TE缓冲液,无水乙醇,70%乙醇,3mol/L NaAc。
4、操作步骤
(1)水稻幼苗或其他禾本科植物基因组DNA 提取
①在50mL离心管中加入20mL提取缓冲液I,60℃水浴预热;
②水稻幼苗或叶子5~10g,剪碎,在研钵中加液氨磨成粉状后立即倒入预热的离心管中,剧烈摇动混匀,60℃水浴保温30~60min,不时摇动;
③加入20mL氯仿:戊醇:乙醇溶液,颠倒混匀(需戴手套,防止损伤皮肤),室温下静置5~10min,使水相和有机相分层;
④室温下 5000r/min 离心5min;
⑤仔细移取上清至另一50mL离心管,加入1倍体积的异丙醇,混匀,室温下放置片刻即出现絮状 DNA 沉淀;
⑥在1.5mL EP管中加入1mL TE。用钩状玻璃棒捞出DNA絮团,在干净吸水纸上吸干,转入含TE的离心管中,DNA 很快溶解于TE;
⑦如 DNA 不形成絮状沉淀,则可用5000r/min 离心 5min,再将沉淀移入 TE 管中。这样收集的沉淀,往往难溶解于TE,可在60℃水浴放置15min 以上,以帮助溶解;
⑧将 DNA 溶液 3000r/min 离心5min,上清倒入干净的 5mL 离心管;
⑨加入5μL RNaseA(10μg/μL),37℃ 10min,除去 RNA(若RNA 对 DNA 的操作、分析无影响,可省略该步骤);
⑩加入1/10体积的3mol/L NaAc及2倍体积的冰乙醇,混匀,-20℃放置 20min左右,DNA 形成絮状沉淀;
⑪用玻璃棒捞出 DNA 沉淀、70%乙醇漂洗,再在干净吸水纸上吸干;
⑫将 DNA 重溶解于1mL TE,-20℃ 贮存;
⑬取 2μL DNA 样品在 0.7%琼脂糖胶上电泳,检测 DNA 的分子大小。同时取15μL稀释 20倍,测定 OD260/OD280,检测 DNA含量及质量。
(2)从李(苹果)叶子提取基因组 DNA
①取3~5g嫩叶,液氮磨成粉状;
②加入提取缓冲液Ⅱ 10mL,再研磨至溶浆状。10000r/min 离心 10min;
③去上清,沉淀加提取缓冲液Ⅰ 20mL,混匀。65℃水浴30~60min,常摇动;
④同本节(1)中步骤③~⑬操作。
5、注意事项
5g样品可保证获得500μg DNA,足供RFLP、PCR等分析之用
图1、植物组织中的DNA示意图
二、从动物组织提取基因组DNA
1、实验材料
哺乳动物新鲜组织。
2、实验设备
移液管,高速冷冻离心机,台式离心机,水浴锅。
3、实验试剂
(1)分离缓冲液10mmol/LTris-HCl(pH7.4),10mmol/L NaCl,25mmol/L EDTA。
(2)其他试剂 液氮,10%SDS,蛋白酶K(20mg/mL或粉剂),乙醚,苯酚:氯仿:异戊醇(25:24:1),无水乙醇及70%乙醇,5mol/L NaCl,3mol/L NaAc,TE,RNaseA(10μg/μL)。
图2、SDS法流程图
4、操作步骤
(1)切取组织5g左右,剔除结缔组织,吸水纸吸干血液,剪碎放入研钵(越细越好)。
(2)倒入液氮,磨成粉末,加10mL 分离缓冲液。
(3)加1mL10% SDS,混匀,此时样品变得很黏稠。
(4)加50μL或1mg蛋白酶K,37℃保温1~2h,直到组织完全解体。
(5)加1mL 5mol/L NaCl,混匀,5000r/min 离心数秒。
(6)取上清于新离心管,用等体积苯酚:氯仿:异戊醇(25:24:1)抽提。待分层后3000r/min 离心 5min。
(7)取上层水相至干净离心管,加2倍体积乙醚抽提(在通风情况下操作)。
(8)移去上层乙醚,保留下层水相。
(9)加1/10体积3mol/L NaAc,及2倍体积无水乙醇,颠倒混合沉淀DNA。室温下静置10~20min,DNA 沉淀形成白色絮状物。
(10)用玻璃棒钩出 DNA沉淀,70%乙醇中漂洗后,在吸水纸上吸干,溶解于1mL TE中,-20℃保存。
(11)如果 DNA 溶液中有不溶解颗粒,可在5000r/min短暂离心,取上清;如要除去其中的 RNA,可加5μL RNaseA(10μg/μL),37℃保温30min,用苯酚抽提后,按步骤(9)~(10)重沉淀 DNA。
总结
本文详细介绍了从植物和动物组织中提取基因组DNA的实验方法,以及操作步骤,旨在为遗传学研究、疾病诊断和生物技术应用提供基础材料。植物DNA提取过程涉及使用特定缓冲液裂解细胞,通过离心、有机溶剂分离DNA,RNA去除与乙醇沉淀,最终TE缓冲液中保存。动物DNA提取则需物理破坏组织,利用蛋白酶处理,酚/氯仿去除蛋白质,乙醚与乙醇沉淀,最终纯化DNA。注意事项强调温和操作保证DNA完整性,适用于RFLP与PCR等分析。文中还提供了具体步骤和细节,如水稻、李叶、动物组织的提取差异操作及关键点,以及RNA去除步骤,确保提取质量。
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更新日期:2024-05-14
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编制人:冬冬