盐硫杆菌科 (Halothiobacillaceae)与盐硫杆菌属 (Halothiobacillus)的物种特征与分类
来源:武汉市灰藻生物科技有限公司 浏览量:47 发布时间:2025-12-31 15:35:29
科 III. 盐硫杆菌科 (Halothiobacillaceae)
一、简介
细胞为杆状,借极生鞭毛运动,含有泛醌 Q-8,为专性需氧型化能无机营养菌。革兰氏阴性,属于γ-变形菌纲,具有耐盐性兼嗜盐性,且为专性化能无机自养菌。其好氧化能自养生长依赖于氧化无机硫化合物或元素硫,并通过卡尔文-本森还原磷酸戊糖循环固定二氧化碳。在自然界中,盐硫杆菌科的成员分布于海水、海洋淤泥、淡水、盐湖和热液喷口等环境中。
其DNA的G+C含量为56–58 mol%。
模式属: Halothiobacillus(盐硫杆菌属) Kelly and Wood 2000, 515 emend. Sievert, Heidorn and Kuever 2000, 1235。
二、分类学评述
盐硫杆菌科是新建立的一个科,目前仅包含盐硫杆菌属一个属,因此该科的特征即为该属章节中所描述的特征。
目前有效发表的四个物种在生理和形态上相似,但其DNA的G+C含量差异相对较大。它们独特的生理特性和生化需求使其与其他所有物种区分开来。对全部四个物种的近乎完整的16S核糖体RNA基因序列分析表明,它们形成了一个单一的系统发育簇。
使用BLASTN和BLAST2对它们的16S rRNA基因序列进行配对比较显示:模式物种那不勒斯盐硫杆菌与其他三个物种的相似度为91.0%至92.9%;凯氏盐硫杆菌与嗜盐盐硫杆菌和热液盐硫杆菌的相似度均为93.4%;而嗜盐盐硫杆菌与热液盐硫杆菌的相似度高达98.6%。作为对比,Allochromatium vinosum ATCC 17899的16S rRNA基因与H. neapolitanus和H. halophilus的相似度分别仅为86.7%和88.0%。通过16S rRNA基因测序,已鉴定出盐硫杆菌属的其他几个菌株,预计在适当的时候将有更多新物种被定义并有效发表。
属 I. 盐硫杆菌属 (Halothiobacillus)
该属细菌为专性化能无机自养的革兰氏阴性杆菌,大小0.3–0.6 × 1.0–2.5 µm,单个或成对出现。其生长所需能量来源于氧化还原性无机硫化合物(包括硫代硫酸盐、连四硫酸盐、连三硫酸盐、硫和硫化物,但不能氧化硫氰酸盐),且无法氧化亚铁。能耐高浓度溶质(例如,4 M NaCl;0.25 M 硫代硫酸钠),部分菌株表现为中度嗜盐,需要NaCl(最适浓度0.4–1.0 M NaCl)。最适生长温度30–42°C,最适pH 6.5–8.0。在还原性硫化合物上生长时,环境pH从中性降至2.5–3.0。含有泛醌Q-8。属于γ-变形菌纲。
其DNA的G+C含量为56–67 mol%。
模式种: 那不勒斯盐硫杆菌 (Halothiobacillus neapolitanus) (Parker 1957) Kelly and Wood 2000, 515 (= Thiobacillus neapolitanus Parker 1957, 86.)
三、补充描述信息
建立此属的目的是为了容纳先前被描述为 Thiobacillus(硫杆菌属)、具有嗜中性、专性化能无机自养且嗜盐或耐盐的物种。目前承认的四个盐硫杆菌属物种的特征见表1。关于氧化硫、化能无机自养的革兰氏阴性杆状细菌各属的性状、分类学与鉴别特征,已汇总于本手册第二卷C部分关于Thiobacillus属章节的表格与图中。
表1. 盐硫杆菌属各物种基本特征
| 特性 | 1. H. neapolitanus | 2. H. halophilus | 3. H. hydrothermalis | 4. H. kellyi |
|---|---|---|---|---|
| G + C 含量 (mol%) | 56 | 64 | 67 - 68 | 62 |
| 细胞大小(μm) | 0.3 - 0.5 × 1.0 - 1.5 | 0.5 × 1.0 | 0.5 × 1.0 | 0.4 - 0.6 × 1.2 - 1.5 |
| 运动性 | + | + | + | + |
| 羧酶体 | + | nd | nd | nd |
| 专性化能无机自养 | + | + | + | + |
| 耐盐性 | + | + | + | + |
| 最适 NaCl 浓度(M) | nd | 0.8 - 1.0 | 0.43 | 0.4 - 0.5 |
| 最大 NaCl 浓度(M) | 0.86 | 4 | 2 | 2.5 |
| 最适 pH 值 | 6.5 - 6.9 | 7.0 - 7.3 | 7.5 - 8.0 | 6.5 |
| pH 范围 | 4.5 - 8.5 | 6.0 - 8.0 | 6.0 - 9.0 | 3.5 - 8.5 |
| 最适温度(℃) | 28 - 32 | 30 - 32 | 35 - 40 | 37 - 42 |
| 将硝酸盐还原为 N₂ | - | - | - | - |
| 利用/氧化以下物质生长: | ||||
| 硫(Sulfur) | + | + | + | + |
| 硫代硫酸盐 | + | + | + | + |
| 连四硫酸盐 | + | + | + | + |
| 连三硫酸盐 | + | + | nd | nd |
注释:
“+” 表示具有该特性;
“nd” 表示未检测(not determined);
“–” 表示不具备该特性。
四、盐硫杆菌属物种鉴别
关于盐硫杆菌属各物种的性状、相似性及鉴别特征,已在其他文献中予以详尽论述。
五、盐硫杆菌属物种列表
1. 那不勒斯盐硫杆菌 (Halothiobacillus neapolitanus)
词源: Ne.a.po.li.tá.nus. 拉丁语形容词,意为“那不勒斯的”;指该物种可能于1902年由Nathansohn首次从那不勒斯的海水中分离得到。
描述:小型杆状,0.3–0.5 × 1.0–1.5 µm。借单根极生鞭毛运动。在硫代硫酸盐琼脂上,菌落小(1–2 mm),圆形、凸起、有光泽,因沉积硫而呈淡黄白色。老培养物菌落中心变为粉红色。在静态液体硫代硫酸盐培养基中,可能积累硫和多聚硫酸盐,培养基因形成硫薄膜而均匀浑浊。通气培养可能短暂积累连四硫酸盐和连三硫酸盐,pH值降至2.8–3.3。恒化器培养不积累中间产物,并将硫代硫酸盐定量转化为硫酸盐。该菌氧化硫、硫化物、硫代硫酸盐、连四硫酸盐和连三硫酸盐,但不氧化硫氰酸盐;利用铵盐或硝酸盐作为氮源。专性化能无机自养。严格好氧。最适生长温度:28–32°C;生长范围:8–39°C。最适生长pH:6.5–6.9;生长pH范围:4.5–8.5。分离自海水、运河水和腐蚀的混凝土中。常见于海洋淤泥和海水。推测广泛分布于淡水、土壤和海洋环境。属于γ-变形菌纲。
DNA的G+C含量(mol%): 56 (Bd)。
模式菌株: ATCC 23641, DSM 15147, NCIB 8539。
GenBank登录号(16S rRNA): AF173169。
2. 嗜盐盐硫杆菌 (Halothiobacillus halophilus)
词源: ha.lo.phí.lus. 希腊语名词 hals 盐;希腊语形容词 philos 喜爱;现代拉丁语形容词 halophilus 嗜盐的。
描述: 细胞为革兰氏阴性小杆状。专性嗜盐,最适生长需1 M NaCl,最高耐受4 M NaCl。专性化能无机自养;好氧生长,可利用硫代硫酸盐、连四硫酸盐或硫;将pH降至5.5–6。也氧化硫化物、连三硫酸盐和连六硫酸盐。在硫代硫酸盐琼脂上,菌落小(1–3 mm),圆形、不透明、光滑、凸起,因沉积硫而变为黄/白色。最适生长温度30–32°C,最适生长pH 7.0–7.3。硝酸盐被还原为亚硝酸盐,但无法在硫代硫酸盐上进行厌氧生长。含泛醌Q-8。分离自西澳大利亚小麦产区的盐湖。属于γ-变形菌纲。
DNA的G+C含量(mol%): 64.2 (HPLC)。
模式菌株: DSM 6132, ATCC 49870。
GenBank登录号(16S rRNA): U58020。
3. 热液盐硫杆菌 (Halothiobacillus hydrothermalis)
词源: hy.dro.ther.má.lis. 现代拉丁语形容词 hydrothermalis,指位于北斐济盆地的一处热液喷口。
描述: 细胞为革兰氏阴性、能运动、不形成芽孢的短杆状,0.5 × 1.0 µm。专性化能无机营养,通过氧化硫代硫酸盐、连四硫酸盐、硫化物或硫进行生长。将硫代硫酸盐培养基的pH降至4.8,且不形成连四硫酸盐。生长范围:pH 6–9,温度11–45°C,NaCl浓度0–2 M;在pH 5或9.5,或温度8°C或50°C时不生长。最适pH 7.5–8,最适温度35–40°C;最适盐度0.43 M NaCl,耐受2 M NaCl。含泛醌Q-8。分离自北斐济盆地裂谷系统活动热液喷口2公里深处的样品。属于γ-变形菌纲。
DNA的G+C含量(mol%): 67.1–67.4 (Tm, Bd, HPLC)。
模式菌株: ATCC 51453, DSM 7121。
GenBank登录号(16S rRNA): M90662。
4. 凯氏盐硫杆菌 (Halothiobacillus kellyi)
词源: kel‘ly.i. 现代拉丁语属格名词 kellyi,属于凯利;以英国微生物学家Donovan P. Kelly的名字命名,他在硫氧化细菌及其生理学研究方面做出了重要贡献。
描述: 细胞为革兰氏阴性、能运动的杆状(0.4–0.6 × 1.2–2.5 µm)。该菌严格好氧,能自养生长于硫代硫酸盐、连四硫酸盐、硫和硫化物上,但不能利用硫氰酸盐。无异养生长能力。以硫代硫酸盐为主要能源时,会短暂形成硫。在还原性硫化合物上生长时,pH从中性降至约2.8。硫代硫酸盐被完全氧化为硫酸盐。在硫代硫酸盐上自养生长的pH范围为3.5–8.5,温度范围为35–49°C;最适生长在pH 6.5、温度37–42°C。最适生长NaCl浓度为0.4–0.5 M;可在0–2 M NaCl浓度范围内生长。硝酸盐不能作为末端电子受体。模式菌株Milos-BIII1在硫代硫酸盐上的平均最大比生长速率为0.45 h-1。在硫代硫酸盐琼脂上,细胞形成白色至淡黄色、光滑、边缘整齐的菌落(在1.2% w/v琼脂上直径为1–4 mm),菌落内有硫沉积并产酸。呼吸链中含泛醌Q-8。经16S rRNA基因序列分析确定,凯氏盐硫杆菌属于γ-变形菌纲,且与盐硫杆菌属其他成员亲缘关系最近。模式菌株Milos-BIII1分离自一处海洋浅水热液喷口系统,保藏于DSM。
DNA的G+C含量(mol%): 62 (HPLC)。
模式菌株: Milos-BIII, DSM 13162。
GenBank登录号(16S rRNA): AF170419。
参考文献
1.Kelly, D.P., E. Stackebrandt, J. Burghardt and A.P. Wood. 1998. Confirmation that Thiobacillus halophilus and Thiobacillus hydrothermalis are distinct species within the gamma-sublass of the Proteobacteria. Arch.Microbiol. 170: 138–140.
2.Kelly, D.P. and A.P. Wood. 2000. Reclassification of some species of Thiobacillus to the newly designated genera Acidithiobacillus gen. nov., Halothiobacillus gen. nov. and Thermithiobacillus gen. nov. Int. J. Syst. Evol.Microbiol. 50: 511–516.
3.Sievert, S.M., T. Heidorn and J. Kuever. 2000. Halothiobacillus kellyi sp.nov., a mesophilic, obligately chemolithoautotrophic, sulfur-oxidizing bacterium isolated from a shallow-water hydrothermal vent in the Aegean Sea, and emended description of the genus Halothiobacillus.Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 50: 1229–1237.
# 翻译自:Bergeys Manual of Systematic Bacteriology (Garrity, Berner, Creig) . Volume Two:The Proteobacteria Part B The Gammaproteobacteria.(Order I. Chromatiales)
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更新日期:2025-12-12
编制人:思琪
审稿人:小藻